ENGLISH https://translate.google.com/translate?sl=bs&tl=en&u=http://bev.ba/MOMARAFO/BG/index.html

GERMAN https://translate.google.com/translate?sl=bs&tl=de&u=http://bev.ba/MOMARAFO/BG/index.html

VAL KOJI ISPRAVLJA DNA GREŠKE U ČOVJEKU: TRENUTNO.

TALAS KOJI ISPRAVLJA DNA GREŠKE U ČOVJEKU: TRENUTNO.

A WAVE THAT CORRECTS DNA ERRORS IN HUMAN BEING: CURRENTLY.

A WAVE THAT CORRECTS DNA ERRORS IN HUMAN BEING: INSTANTLY.

Krug prijatelja Brune Greninga

KAKO TO RADI - ISTRAŽIVAČKI RAD RUDOLF BOŠNJAK

Tekst u slici ispod je iz originalnog audio snimka glasa Brune Greninga, gdje on govori:

I ONDA TI ŠALJEM ISCJELITELJSKI VAL.

Ovdje su moje verzije dekodiranja te rečenice i ko se potrudi i unese se, možda shvati i razumi,

šta ta rečenica objašnjava i otkriva kao način djelovanja...način komunikacije između kromozoma i ćelija.

ISCJELITELJSKI VAL

IS CjELI TEL SKI VAL

IS CELL I TELL SKI VAL

IS CELL I TELL WAVE JE LI ĆELIJA KAŽEm TALASU JE LI STANICA KAŽEm TALASU

Kakav je to val-talas iscjeliteljski?

Odakle se emituje taj val-talas?

Kako je modulisan ovaj val-talas?

Ima toliko mnogo pitanja ???????? bez odgovora...

ali zajedničkim radom možemo doći do tačnih odgovora šta je to ISCJELITELJSKI VAL

ORIGINAL GLAS BRUNO GRENING 1

Bruno Gröning – Lecture in Springe, October 3rd 1958 – Part 1

https://youtu.be/3zNqob2vHQA

Dragi, moji tražitelji pomoći!

Svaki tražitelj iscjeljenja može primiti samo, ako se oslobodi od svoje tegobe.

(Primjer kodirane riječi napisane naopako e bog et ili tegoba-a bog et )

Molim Vas, odvojite se od svoje tegobe, i onda Vam šaljem iscjeliteljski val.

Primi ga, i dalje promatraj. gledaj svoje tijelo, osluškuj svoje tijelo, skoncentriraj se na to, što se događa u Tvom tijelu.

Ima puno toga što se ne može objasnit, ali ničega što se ne može dogodit.

ORIGINAL GLAS BRUNO GRENING 2

Bruno Gröning - Lecture in Springe, October 4, 1958 - Part 1

https://youtu.be/oaIfvrDc6lo

Upućujem Vas na to, dragi prijatelji, mi - svakom je čovjeku potrebno, da traži Boga, da ga on opet vrati na za njega Bog-om određeni put.

Zato Ti dovikujem, zato dovikujem svakom; Stani! sad kad si spoznao da taj put, kojim si krenuo, da taj put nije ispravan, nikada dobar, već samo loš onda se zaustavi, ne idi dalje tim putem.

Kažem; Idi ka velikom preokretu!

Uzdaj se i vjeruj! Božanska snaga pomaže i iscjeljuje.

Slijedi onoga koga svi trebaju slijedit.

Taj Jedini, kojeg trebamo slijedit, dragi prijatelji, je i ostaje sam Bog.

Jer nesreća nestaje tek tada, kad se čovjek sam, to znači, kad se on opet veže sa Bogom.

Vjeruj u dobro, vjeruj u Božansko, vjeruj u Boga!

Daruj svom tijelu istinsku pozornost, odvojite se od sveg zla, u sebi primi dobru, Božansku snagu!

Tako nećeš osjetit što, već to da zlo nestaje iz Tvog tijela,

Voli život, Boga - a Bog je svuda.

Novac je moć. a zdravlje je svemoć.

DOKUMENTARNI FILM BRUNO GRENING

https://youtu.be/6gfdXvE0lQg

The PHENOMENON BRUNO GROENING – documentary film – PART 1

https://youtu.be/Ysv1UHzCcSQ

The PHENOMENON BRUNO GROENING – documentary film – PART 2

Ne znam puno, ništa drugo ne znam osim onoga što ljudi danas više ne znaju, želim biti samo putokaz.

Ja sam samo mali sitan Božiji alat, i nikad ne reci da sam Te ja iscjelio, ne, ja sam samo mali posrednik, ništa više, sitnica na transformatoru kome je pomoć dodjeljena treba zahvalit Bogu.

(Šta znače riječi sitnica na transformatoru) a ispod je slika transformator i šta se iz čega trasformira u šta. Ja sam transformator bog energije, bog je centrala, ja sam transformator, vi ljudi ste kao žaruljice od 12 volti, ako bi vas se priključilo na 220 volti, žaruljica bi se rasprsnula. Znači mora biti transformator...

Ja sam ništa, Bog je sve.

Ja ne moram biti prisutan da bi Ti primio val iscjeljenja, ništa to nije vezano uz tijelo.

Potok iscjeljenja

Kako se sve ovo događa? Koja je snaga koja stoji iza iscjeljenja? A ko je, Bruno Grening?

Nema ničeg posebno sablasnog ili spektakularnog u iscjeljenjima, jer Bruno Grening, pokojni pokretač pokreta - preminuo je 1959. - jednostavno je uzimao neku nama ne znanu energiju svemira. Ono što bi nazvali prana, ili Kinezi Chi, Grening je nazvao Heilstrom (iscjeliteljski tok, iscjeliteljski val, iscjeliteljski talas). a ja Rudolf Bošnjak sam to nazvao:

VAL KOJI ISPRAVLJA DNA GREŠKE U ČOVJEKU: TRENUTNO.

TALAS KOJI ISPRAVLJA DNA GREŠKE U ČOVJEKU: TRENUTNO.

A WAVE THAT CORRECTS DNA ERRORS IN HUMAN BEINGS: CURRENTLY.

A WAVE THAT CORRECTS DNA ERRORS IN HUMAN BEINGS: INSTANTLY.

Upravo se na taj tok neznane energije pozvao kako bi stotinama svojih pacijenata olakšao izlječenje. Iznova je zvao svoje sljedbenike da vjeruju u Bog-je-ove iscjeliteljske moći. "Vjeruj i vjeruj da Božanska sila pomaže i liječi", često se citira. „Odvoji se od bolesti. Ne pripada tebi. Pomoći ću vam da se ponovo vežete sa božanskom snagom, “rekao je ističući pravilo broj jedan o duhovnom iscjeljenju - priznanje da je neko urođeno cjelovit i savršen i da bolest ili malaksalost nisu sastavni dio onoga što mi jesmo i zbog toga možemo odustati u trenutku kada pravimo razliku između njega i nas.

Bruno Grening nikada nije nikoga liječio, a samim tim ni u tradicionalnom medicinskom smislu. Izlječenja su se dogodila kad su ljudi svjesno odlučili uspostaviti svoju vezu sa Bogom. „Vjera u dobro preduvjet je za postajanje zdravim koliko i volja za tim. Ljudi su svuda okruženi iscjeljujućim valovima koje jednostavno upijaju “, primijetio je sa mudrom oštroumnošću.

Grening (1906 - 1959) rođen je 1906 u Danzig-Olivi, Njemačka, četvrto od sedmero djece i bio je jednostavan radnik. Od vrlo ranog djetinjstva bio je svjestan da kroz njega teče energija za liječenje drugih. Ljudi su mu se gomilali i bili su izliječeni od bolesti, nelagoda, loše zdravlje duha i tijela čudesno! Njegova slava bila je na vrhuncu nakon Drugog svjetskog rata, tokom 1940. i 50. godine, kada bi se čak 30.000 ljudi okupilo za njegove masovne sesije isceljenja.

Na žalost, kao mnogo evoluiranih duša prije njegovog vremena, Greninga su zbog njegovih izlječenja progonili medicinski radnici i na kraju su ga progonili do smrti. Ali učenja nisu umrla sa njim.

Radeći širom zemalja, još od njegove smrti 1959. godine, njegova prijateljica Grete Häusler (1922. - 2007.) osnovala je ono što danas znamo kao Krug prijatelja 1979. Zadatak Kruga prijatelja je sačuvati nasljeđe Brune Greninga za potomstvo i ponuditi ga i ljude ubijedit u mogućnost dobijanja pomoći i izlječenja.

Grete Häusler opisi dešavanja

The Healing Report of Grete Häusler (1922-2007) -- For her 100th Birthday

https://youtu.be/_Q_-OCoevx0

Isprva je bila samo nekolicina istomišljenika, ali krajem 80-ih njegov je rast bio brz. Krug prijatelja Brune Greninga danas je jedno od najvećih udruženja za duhovno iscjeljenje na površini planet Zemlja. Kao što je Bruno Grening rekao: sve se financira iz donacija i nema plaćeno osoblje. Pridruživanje Krugu dobrovoljno je i besplatno. Takođe ne postoje nacionalne, ideološke ili konfesionalne veze. Sve aktivnosti su besplatne. Troškovi se podmiruju dobrovoljnim donacijama. Naš svijet, globalno selo, a opet rastrgan ratovima, terorizmom, bolom, tugom i bijedom ljudske nevolje, treba zacjeljivanje. Možda učenje Brune Greninga ima odgovor na naše očajno stanje. Međutim, čovjek mora imati otvoreno srce da bi primio učenje kao i iscjeliteljske valove, iscjeliteljske talase - heilstroma.

Postupak zacjeljivanja prilično je jednostavan. Jednostavno sjedi sa neprekriženim stopalima i rukama, podignutim dlanovima i traži od Brune da uvede red u tvoj život i tijelo slanjem iscjeljujućeg vala - heilstroma.

Brunu možeš zamijeniti Bogom ako ti je neugodno molit se čovjeku. Većina ljudi osjeti vibraciju ili ugodno trnjenje u dlanovima, što je pokazatelj da je iscjeljujući val - heilstrom u toku. Osjećaj je ugodan i smirujući, a čovjek dolazi energičan. Postoje lokalne grupe koje se sastaju svakog tjedna ili tako i vježbaju grupno zacjeljivanje koje se smatra još efikasnijim. Sve u svemu, postoji čistoća i ozbiljnost namjere u vezi s organizacijom koja je privlačna u vrijeme kada komercijalni interesi kvare svaki duhovni poduhvat.

„Kad više ne budem sa ove zemlje kao čovjek, to jest kad se odreknem tijela, tada će čovječanstvo doći dotle da će svaka osoba moći iskusiti pomoć i iscjeljenje iz sebe“, Bruno trebalo je da kaže tokom njegovih poslednjih dana. Zar mu ne možemo vjerovati na riječ i iskoristiti snagu u sebi da se oslonimo na iscjeliteljsku energiju koja nas okružuje i uspostavimo savršeno zdravlje za sebe?

Na rubu znanosti - KRUG PRIJATELJA BRUNE GRENINGA 07.01.2011.

https://youtu.be/1umlA5YRl_c

Ja sam transformator bog energije, bog je centrala, ja sam transformator,

vi ljudi ste kao žaruljice od 12 volti, ako bi vas se priključilo na 220 volti, žaruljica bi se rasprsnula.

Znači mora biti transformator...

Bruno Grening - Predavanje u Špringeu, 4. oktobra, 1958. - 1. Dio

U ovom originalnom predavanju iz 1958. prvo govori vođa Zajednice. Nakon toga, Bruno Grening u svom predavanju naglašava razliku između mišljenja i uvjerenja i zove svoje slušaoce da se uvijek uvjere u sve. Takođe naglašava razliku između ljudskog zakona i božanskog zakona: u ljudskom onaj ko to može dokazati dobija pravo, u božanskom onaj koji zaista ima pravo.

Krug prijatelja Bruna Greninga objavljuje originalna predavanja Bruna Greninga. Bruno Grening držao je ova predavanja u uskom krugu svojih zajednica i gotovo isključivo pred hrišćanima. Zbog toga je ponekad govorio o Hristu i pozivao se na njega. Budući da su ova predavanja danas prevedena na različite jezike i dostupna ljudima svih religija, Krug prijatelja je odlučio da izostavi takve, po pravilu, vrlo kratke pasuse. Učenja i duhovna pomoć i isceljenja Bruna Greninga su za sve ljude, bez obzira na njihovu religiju, bez postavljanja verskih barijera - prema Brunu Greningu: "Ne pitam za religiju, ne pitam za naciju. Nije važno kojoj religiji pojedinac pripada. I zato: Ne možemo govoriti o jednoj religiji, o jednoj religiji. Moramo je uzeti uopšte, jer su svi ljudi; ljudi, uvek kažem: Božja deca. "

https://youtu.be/55WdTkFRwDY

Bruno Grening - Predavanje u Špringeu, 4. oktobra, 1958. - 2. Dio

https://youtu.be/TTnDqupPDkk

Bruno Grening - Predavanje u Špringeu, 4. oktobra, 1958. - 3. Dio

https://youtu.be/_ZSUPCeDhqI

Nepoznati iscjelitelj | Audio knjiga o Brunu Greningu, dio 1.

https://youtu.be/iiZgpUFI-n4

3. Na rubu znanosti: Bruno Grening (07.04.2012.)

https://youtu.be/m9hkkih_K1c

https://www.youtube.com/embed/e9Nd4QB2I38

U nakon ratnoj Njemačkoj djelovao je skroman i neobrazovan čovjek nevjerojatnih iscjeliteljskih sposobnosti - Bruno Grening. O njemu su izvještavali štampane novine, radio i sedmične novosti. Mjesecima su događaji oko ovog "čudotvornog doktora", kako su ga uskoro nazvali, bili u središtu pažnje tek osnovane mlade Republike Njemačke. O slučaju Brune Greninga bio je snimljen dugometražni film, fenomen je istraživala komisija sastavljena od vrhunskih naučnika tog dobe, a o njemu se raspravljalo u i najvišim organima državne uprave. Ministar rada i socijalne pomoći pokrajine Sjeverna Rajna-Vestfalija dao je tajno pratit Brunu Greninga zbog sumnji da krši zakon. Predsjednik Vlade pokrajine Bavarske zastupao je suprotno mišljenje, da se ne smije dopustiti da se jedna takva "izuzetna osoba" kao Grening zaustavi i utopi u paragrafima. Ministarstvo unutarnjih poslova pokrajine Bavarske označilo je njegovo djelovanje kao "slobodno djelovanje ljubavi". Krug prijatelja Brune Gröninga postoji i danas.

OPISANA ZNANJA U TEKSTU ISPOD, BILA SU ZNANA ILI POZNATA U VRIJEME ŽIVOTA BRUNE GRENINGA

DNA-DNK, geni i genetsko inženjerstvo

Napisao Neysan Donnelly

1866. godine, redovnik koji govori njemački jezik Gregor Johann Mendel iz današnje Češke objavljuje naučnu raspravu o nasljeđivanju svojstava graška ...

… Pet godina kasnije, švajcarski istraživač zvan Friedrich Miescher izolira misterioznu supstancu bogatu fosfatima iz jezgara bijelih krvnih zrnaca, koje krštava „nuklein“.

Čini se da ova dva otkrića nisu međusobno vezana; u svakom slučaju, nijedno djelo u to vrijeme nije stvorilo velike valove. Međutim, Mendel i Miescher otvorili su put otkrivanju i karakterizaciji DNA-DNK i omogućili istraživačima da utvrde da DNA sadrži gene, pojedinačne jedinice koje kodiraju različite funkcije potrebne za život i koje posreduju u prenošenju osobina kroz generacije.

Nakon Miescherove izolacije znatiželjne supstance, drugi su istraživači tada preuzeli palicu i uhvatili se u koštac s karakterizacijom njene kemijske strukture.

https://www.youtube.com/embed/_Q_-OCoevx0

Albrecht K biokemičar iz Rostocka u Njemačkoj utvrdio je da se "nuklein" sastoji i od proteina i od proteina. Njegovo krunsko dostignuće, za koje je dobio Nobelovu nagradu za fiziologiju ili medicinu 1910. godine, bila je eventualna izolacija pet takozvanih nukleobaza iz ne-proteinskog dijela: adenin, citozin, gvanin, timin i uracil. Sljedeća velika prekretnica bila je razjašnjenje hemijske strukture ovih gradivnih blokova DNA-DNK. Nobelova nagrada za hemiju 1957. godine dodeljena je Aleksandru Todu kao priznanje studijama sinteze i razgradnje koje su dovele do spoznaje da su nukleotidi sastavljeni od šećera, baze i fosfata.

Do 1900. godine, Mendelova načela su nezavisno provjerila, a zatim su ih opet odtkrila najmanje još četiri naučnika, a odtprilike 10 godina ranije holandski botaničar Hugo de Vries predložio je da nasljeđivanje osobina može biti posredovano diskretnim elementima ili česticama, nazvanim "pangenes". Gdje su bili ti misteriozni "pangeni"?

Nekoliko njemačkih i švicarskih naučnika od sredine 1800-ih godina nadalje nezavisno je promatralo strukture koje danas znamo kao hromozome. Međutim, tek na prelazu vijeka dvojica istraživača, Amerikanac Walter Sutton i Nijemac Theodor Boveri, ukazali su na hromozome kao na nosioce genetskog materijala, takozvanu teoriju nasljeđivanja hromozoma. Naknadni rad dvojice Amerikanaca: Eleanor Carothers i, što je najpoznatije, Thomas Morgan, pružio je snažnu potporu ovoj teoriji. Carothers je prvi primijetio da se hromozomi neovisno sortiraju tijekom mejoze, dok je Morgan u eksperimentima sa voćnim mušicama pokazao da su određene osobine kodirane na spolnim hromozomima i da je vjerovatno da su i druge osobine nošene na drugim pojedinačnim hromozomima. Morgan je za svoja otkrića dobio Nobelovu nagradu za fiziologiju ili medicinu 1933. godine. Rođena je moderna genetika.

Međutim, još uvijek nije bilo razumijevanja stvarnog sastava genetskog materijala. Zapravo se mnogo godina smatralo da protein posreduje u prenošenju osobina i karakteristika. Ova ideja zadržala se sve do osnovnih eksperimenata Amerikanca Oswalda Averyja 1944. Avery je uspio prenijeti sposobnost izazivanja bolesti između bakterijskih sojeva i dokazati da je nukleinska kiselina ta koja prenosi ovu sposobnost. To je pokazalo da su geni sastavljeni od nukleinske kiseline. Otprilike u isto vrijeme kad su objavljena ova otkrića Averyja, daljnji zamah dao je možda malo vjerojatan izvor: Erwin Schrödinger, nobelovac za fiziku 1933. U nizu predavanja održanih u Irskoj 1943. austrijski fizičar iznio je ideje koje bi mogle imati ogroman utjecaj na generaciju fizičara i biologa. Schrödinger je tvrdio da genetski materijal mora sadržavati "kodnu skriptu" koja određuje razvoj jedinke.

Inspirisan nalazima Avery-a da proučava DNA-DNK, austrougarski naučnik po imenu Erwin Chargaff formulirao je zakon sa dubokim implikacijama. Uspio je dokazat da je u prirodnim uslovima broj nukleobaza gvanina jednak broju citozina i da je broj adenina jednak broju nukleobaza timina. To snažno sugeriše da su se ove četiri baze međusobno uparile u molekulama DNA-DNK, tj. Gvanin sa citozinom, a adenin sa timinom. Sada je stavljena pozornica za možda najspektakularnije otkriće u istoriji istraživanja DNA-DNK: utvrđivanje njene molekularne strukture i spoznaja da je slijed baza odgovoran za određivanje osobina koje su primijetili Mendel, Sutton, Boveri i drugi, te je "kodna skripta" o kojoj govori Schrödinger.

Otkriće strukture DNA-DNK od strane Amerikanca Jamesa Watsona, britanskog naučnika Francisa Cricka i Mauricea Wilkinsa rođenog na Novom Zelandu nesumnjivo je inspirisano ovim ranijim radom. Međutim, dobila je i mnogo direktniju pomoć: od britanskog kristalografa Rosalind Franklin. Zaključila je da su molekuli fosfata u DNA-DNK locirani na vanjskoj površini molekule DNA-DNK, a također je napravila procjenu količine vode koja se u njoj nalazi. Dalje, njena čuvena „Fotografija 51“, rendgenska slika DNA-DNK koja daje nejasnu strukturu u obliku X bio je kasnji nagovještaj koji je Watsonu i Crick-u trebao da bi napravili svoj proboj. Predložili su model u kojem je DNA-DNA dvostruka zavojnica dvije anti-paralelne niti sa fosfatom izvana i bazama koje se međusobno spajaju iznutra. Osim što su otvorili put za odljučavanje koda DNA i gena, Watson, Crick i Wilkin-ovi nalazi imali su i duboke implikacije na to kako se DNA-DNK replicira, što su sami naučnici odmah prepoznali. James Watson razgovarao je o ovim implikacijama u odnosu na replikaciju virusa na svom predavanju 1967. godine na sastanku nobelovca Lindau:

Lektura i popravak DNA-DNK - Očitavanje i popravak DNA-DNK dokaza

Mehanizmi za ispravljanje grešaka tokom replikacije DNA-DNK i za popravak oštećenja DNA-DNK tokom životnog vijeka stanice.

Ćelije-stanice imaju razne mehanizme za sprečavanje mutacija ili trajnih promjena u sekvenci DNA-DNK.
Tokom sinteze DNA-DNK, većina DNK-DNK polimeraza "provjerava svoj rad", popravljajući većinu pogrešno uparenih baza u procesu koji se naziva lektura.
Neposredno nakon sinteze DNA-DNK, sve preostale neispravne baze mogu se otkriti i zamijeniti postupkom koji se naziva popravak neusklađenosti.
Ako se DNA-DNK ošteti, može se popraviti različitim mehanizmima, uključujući kemijski preokret, popravak izrezivanjem i dvostruki popravak prekida.

Uvod
Kakve veze DNA-DNK ima sa rakom? Rak se javlja kada se stanice nekontrolirano dijele, zanemarujući normalne signale "zaustavljanja" i stvarajući tumor. Ovo loše ponašanje uzrokovano je nakupljenim mutacijama ili trajnim promjenama sekvence u DNA-DNK stanica.

Greške replikacije i oštećenja DNA-DNK zapravo se stalno događaju u stanicama naših tijela. U većini slučajeva, međutim, ne uzrokuju rak, pa čak ni mutacije. To je zato što ih obično otkrivaju i popravljaju mehanizmi lekture i popravljanja DNA-DNK. Ili, ako se oštećenje ne može popravit, stanica će doživit programiranu staničnu smrt (apoptozu) kako bi se izbjeglo prenošenje neispravne DNA-DNK.
Mutacije se događaju i prenose se na stanice kćeri samo kada ti mehanizmi zakažu. Rak se razvija samo kada se višestruke mutacije gena vezanih sa djelom nakupljaju u istoj stanici.
U ovom ćemo članku bliže gledati mehanizme koje stanice koriste za ispravljanje pogrešaka replikacije i popravljanje oštećenja DNA-DNK, uključujući:

Lektura, koja ispravlja greške tokom replikacije DNA-DNK
Popravak neusklađenosti, koji popravlja neispravne baze odmah nakon replikacije DNA-DNK
Putovi sanacije oštećenja DNA-DNK koji otkrivaju i ispravljaju oštećenja tijekom staničnog ciklusa

Korektura
DNA-DNK polimeraze su enzimi koji grade DNA-DNK u stanicama. Tokom replikacije DNA (kopiranja), većina DNA polimeraza može "provjeriti svoj rad" sa svakom bazom koju dodaju. Taj se postupak naziva lektura. Ako polimeraza otkrije da je dodan pogrešan (pogrešno uparen) nukleotid, ona će odmah ukloniti i zamijeniti nukleotid, prije nego što nastavi sa sintezom DNA1 ^ 11početni nadpis, 1, krajnji nadpis.
Lektura:

1. DNA polimeraza dodaje novu bazu na 3 'kraju rastućeg, novog lanca. (Predložak ima G, a polimeraza novom lancu pogrešno dodaje T, a ne C.)

2. Polimeraza otkriva da su baze pogrešno uparene.

3. Polimeraza koristi 3 'do 5' eksonukleazne aktivnosti za uklanjanje netočnog T s 3 'kraja novog lanca.
Korektura:

DNA polimeraza dodaje novu bazu na 3 'kraju rastućeg, novog lanca. (Predložak ima G, a polimeraza novom lancu pogrešno dodaje T, a ne C.)
Polimeraza otkriva da su baze pogrešno uparene.
Polimeraza koristi 3 'do 5' eksonukleazne aktivnosti kako bi uklonila netočni T s 3 'kraja novog lanca.

Popravak neusklađenosti
Mnoge se greške ispravljaju lekturom, ali neke se provuku. Opravak neusklađenosti događa se odmah nakon izrade nove DNA, a njezin posao je uklanjanje i zamjena pogrešno uparenih baza (onih koje nisu bile popravljene tijekom lekture). Opravak neusklađenosti također može otkriti i ispraviti mala umetanja i brisanja koja se događaju kada polimeraze "skliznu", kad izgube oslonac na predlošku2 ^ 22squared.
Kako funkcionira opravak neusklađenosti?

Prvo, proteinski kompleks (skupina proteina) prepoznaje i veže se za neispravnu bazu. Drugi kompleks presijeca DNK u blizini neusklađenosti, a više enzima isječe netočni nukleotid i okolni dio DNA. DNA polimeraza tada nadomješta dio koji nedostaje ispravnim nukleotidima, a enzim nazvan DNA ligaza zatvara prazninu2 ^ 22 na kvadrat.

Popravak neusklađenosti.

1. Otkriva se neusklađenost novosintetizirane DNA. U novom pramenu nalazi se G uparen sa T u predlošku (stari) pramen.

2. Novi DNA lanac se prereže i ukloni se dio DNA koji sadrži pogrešno upareni nukleotid i njegove susjede.

3. Nestali flaster zamjenjuje se ispravnim nukleotidima DNA polimerazom. 4. DNA ligaza zatvara preostalu prazninu u DNA okosnici.

Opravak neusklađenosti.

Otkriva se neusklađenost u novo sintetiziranoj DNA. U novom pramenu nalazi se G uparen s T u predlošku (stari) pramen.
Novi DNA lanac se prereže i ukloni se dio DNA koji sadrži pogrešno upareni nukleotid i njegove susjede.
Nedostajući flaster zamjenjuje se ispravnim nukleotidima DNA polimerazom.
DNA ligaza zatvara preostalu prazninu u DNA okosnici.

Jedno se možda pitate kako proteini koji sudjeluju u popravljanju DNA mogu reći "tko je u pravu" tijekom popravka neusklađenosti. Odnosno, kada su dvije baze pogrešno uparene (poput G i T na gornjem crtežu), koja bi od te dvije trebala biti uklonjena i zamijenjena?
U bakterijama se izvorni i novonastali lanci DNA mogu razlikovati pomoću značajke tzv

DNA proofreading and repair

https://www.khanacademy.org/science/high-school-biology/hs-molecular-genetics/hs-discovery-and-structure-of-dna/a/dna-proofreading-and-repair

OPISANA ZNANJA U TEKSTU ISPOD, NISU BILA ZNANA ILI POZNATA U VRIJEME ŽIVOTA BRUNE GRENINGA

Provjera i opravak grešaka DNK i RNK, nevjerovatni dokazi o dizajnu

Tan, promjena; Stadler, Rob. Stubište do života:

Srećom, živi organizmi obdareni su širokim spektrom specijaliziranih mehanizama za opravak DNK-DNA kako bi se suprotstavili tim svakodnevnim napadima: opravak ekscizije baze, popravak nukleotida, popravak homologne rekombinacije, popravak neusklađenosti, fotoreativacija, nehomologno spajanje krajeva, translezijska sinteza i obrada MRN-om kompleks. Osnovni mehanizam za opravak ekscizije javlja se kod prokariota i eukariota i zahtijeva koordinirane napore najmanje pet enzima da izvrše male popravke na DNK. Mehanizam za popravak ekscizije nukleotida, također vrlo raširen tokom života, cilja veće štete. U E. coli, za opravak ekscizije nukleotida treba pet enzima koji zamjenjuju traku od dvanaest nukleotida kada se otkrije oštećenje DNK. Ovi putevi opravljanja čuvaju informacije putem vrlo specifičnih aplikacija energije; za proizvodnju i funkciju enzima potrebna je energija.

Pored opravljanja oštećenja na postojećoj DNK-DNK, živi organizmi imaju mehanizme za ispravljanje grešaka tokom reprodukcije. Bakterije imaju tri vrste DNK polimeraze, koje su sve sposobne otkriti neispravno uparivanje baze, poduprijeti jedan korak za izrezivanje netačnog nukleotida, a zatim napredovati u procesu koji se naziva lektura. Korak lekture smanjuje stopu grešaka kod bakterija sa približno jedne greške u 100.000 baznih parova na jednu grešku u 10.000.000 baznih parova. Kritična važnost mehanizama za popravak DNK u svim živim organizmima odmah stvara zagonetku: mehanizmi za popravak DNK sami su kodirani u DNK koji zahtijeva mehanizme za popravak. Zamislite da je svijet prepun lopova, a vi imate prvu svjetsku ideju o sigurnosnom sistemu koji će odvratiti sve lopove. Planirate proizvoditi sigurnosni sistem u fabrici. Međutim, kako započinjete izgradnju fabrike, lopovi neprestano kradu nacrte, sirovine, čak i sredstva potrebna za izgradnju fabrike. Fabrika nikada neće biti dovršena i nikada se neće proizvoditi sigurnosni sistem. Slično tome, mehanizmi za popravak DNK ne bi mogli evoluirati bez zaštite mehanizama za popravak DNK. A obična DNK nije mogla evoluirati prije nego što su se razvili geni za popravak DNK.

Održavanje genetske stabilnosti koja je organizmu potrebna za preživljavanje zahtijeva ne samo izuzetno precizan mehanizam za replikaciju DNK, već i mehanizme za popravak mnogih slučajnih lezija koje se neprestano javljaju u DNK. Očito je da je mehanizam popravka od suštinskog značaja za preživljavanje ćelije. Nije mogao evoluirati nakon što je život nastao, ali je morao postojati prije. Mehanizam je vrlo složen i razrađen, što ima za posljedicu da je zaključak o dizajnu opravdan i čini se da je najbolji način da se objasni njegovo postojanje.

5ʹ => 3ʹ polimerizacija 1 na 100.000
3ʹ => 5ʹ eksonukleolitička lektura 1 od 100
Popravak neusklađenosti usmjerenih na pramenove 1 na 1000
Kombinovano 1 na 10.000.000.000

Jon Lieff MD: Lektura DNK, Ispravljanje mutacija tokom replikacije, Stanični samoupravni inženjering
Tijekom replikacije kopiraju se nukleotidi koji čine DNK. Kada E coli napravi kopiju svoje DNK, napravi približno jednu grešku na svakih milijardu novih nukleotida. Može kopirati oko 2000 slova u sekundi, završavajući čitav postupak replikacije za manje od sat vremena. U poređenju sa humanim inženjeringom, ova stopa grešaka je nevjerovatno niska. E coli čini tako malo grešaka jer se DNK lektorira na više načina. Enzim, DNK polimeraza, kreće se duž DNK lanaca da započne kopiranje koda sa svakog lanca DNK. Ovaj postupak ima stopu grešaka otprilike jedna na 100.000: prilično visoka. Međutim, kada se dogodi greška, DNK polimeraza nepravilnost osjeti kao izobličenje strukture nove DNK i zaustavlja ono što čini. Nije jasno kako protein to može osjetiti. Drugi molekuli tada dolaze da poprave grešku, uklanjajući pogrešnu nukleotidnu bazu i zamjenjujući je ispravnom. Nakon korekcije, polimeraza nastavlja. Ovaj mehanizam korekcije povećava tačnost 100 do 1000 puta.

Drugi krug lekture
Ipak, još uvijek postoje neke greške koje izbjegavaju prethodni mehanizam. Za njih, tri druga složena proteina prelaze preko nedavno kopirane sekvence DNA. Prvi protein, nazvan MutS (za mutatora), osjeća distorziju u obliku zavojnice nove DNK i veže se za regiju pogrešnim nukleotidima. Drugi protein, MutL, osjeća da je njegov brat S vezan i donosi treći protein i vezuje ta dva. Treći molekul zapravo smanjuje grešku s obje strane. Tri proteina zatim označe netačan dio metilnom grupom. U međuvremenu, stvara se još jedan djelomični lanac DNK za dotičnu regiju, a drugi skup proteina izrezuje tačnu količinu DNK koja je potrebna da popuni prazninu. With prisutni su i pogrešni komad i novokovani ispravan komad, a drugi protein određuje koji je ispravan pomoću metilne pločice. Odnosno, na ispravnom nije oznaka metila. Ovaj novi, tačni odjeljak se zatim donosi i dodaje originalnom lancu DNA. Ova druga lektura je sama po sebi efikasna 99% i povećava ukupnu tačnost replikacije za dodatnih 100 puta.

Više senzora
Postoji više mjesta na kojima protein „osjeća“ šta treba učiniti. Kompjutersko otkrivanje izvorne greške ne može biti usmjereno originalnom DNK. Jasno je da postoje i drugi izvori odlučivanja u ćeliji. Iako je DNK-ova „kontrola kvaliteta“ izuzetno složena u E.Coli, isti proces je još složeniji u ljudskoj ćeliji. Ljudske ćelije sadrže mnogo različitih polimeraza i mnogo drugih enzima za rezanje i popravljanje grešaka. Postoje čak i različiti sustavi tipa Mut koji, uz ostale lekture, čine replikaciju ljudske DNK nevjerovatno tačnom. Najnovija istraživanja pokazala su neke od složenih mehanizama porodice MutL molekula za korekciju mutacija. To pokazuje da molekul energije ATP stimulira proces kojim MutL reže DNK oko greške. U molekuli MutL postoje dva žljeba, jedan za ATP i jedan za DNA lanac. Kada se ATP veže za MutL, on mijenja oblik proteina koji omogućava rezanje. Kod ljudi kada MutL ne funkcionira pravilno poznato je da uzrokuje rak.

Iako mutacije pomažu u određivanju evolucijske raznolikosti, još uvijek ne znamo kako su nastale te vrlo složene i višeslojne kontrole kvalitete i kako su usmjerene. Da li je moguće da DNK režira svoje uređivanje? Ti procesi nekako znaju koje su odgovarajuće sekvence DNA, a koje ne.

Mogućnosti popravka ćelija. 20
Prvo, dakle, sve stanice od bakterija do čovjeka posjeduju zaista zapanjujući niz sistema za opravak koji služe za uklanjanje slučajnih i stohastičkih izvora mutacije. Višestruki nivoi lektorskih mehanizama prepoznaju i uklanjaju greške koje se neizbježno javljaju tijekom replikacije DNK. Ovi lektorski sustavi mogu razlikovati novo sintetizirane i roditeljske niti dvostruke zavojnice DNA, tako da djeluju efikasno radi ispravljanja, a ne popravljanja rezultata slučajnih pogrešnih korporacija pogrešnog nukleotida. Ostali sistemi skeniraju DNK koja se ne replicira radi hemijskih promjena koje bi mogle dovesti do pogrešnog kodiranja i uklanjanja modificiranih nukleotida, dok dodatne funkcije nadziru bazene prekursora i uklanjaju potencijalno mutagene zagađivače. U očekivanju hemijskih i fizičkih uvreda genoma, kao što su alkilirajuća sredstva i ultraljubičasto zračenje, dodatni popravni sustavi kodirani su u genomu i mogu se navesti da ispravljaju oštećenja kada se pojave. Iznenadilo je saznanje koliko se temeljito ćelije štite od vrsta slučajnih genetskih promjena koje su, prema konvencionalnoj teoriji, izvori evolucijske varijabilnosti. Zahvaljujući svojim lektorskim sistemima i sistemima za popravak, žive ćelije nisu pasivne žrtve slučajnih sila hemije i fizike. Oni posvećuju velike resurse suzbijanju slučajnih genetskih varijacija i imaju kapacitet da podese nivo pozadinske lokalizovane mutabilnosti prilagođavanjem aktivnosti njihovih sistema popravki.

https://reasonandscience.catsboard.com/t2043-dna-and-rna-error-checking-and-repair-amazing-evidence-of-design

Provjera i popravak DNK i RNA grešaka, nevjerojatni dokazi dizajna Dna_re10

Oštećenje DNK je promjena u hemijskoj strukturi DNK, poput pucanja lanca DNK, baze koja nedostaje u okosnici DNK ili kemijski promijenjene baze. Oštećenja DNK u prirodi nastaju više od 60.000 puta dnevno po ćeliji sisara. Čini se da je oštećenje DNK osnovni životni problem. Oštećenja DNK glavni su primarni uzrok raka. Oštećenja DNK uzrokuju mutacije i epimutacije. Ako se mutacije ne korigiraju, mutacije će se širiti tijekom sljedećih generacija ćelija. Tako visoka stopa slučajnih promjena u sekvenci DNK imala bi katastrofalne posljedice za organizam

Postoje različiti putevi za popravak DNK,

Popravak ekscizije nukleotida (NER),
Popravak ekscizije baze (BER),
Popravak DNK neusklađenosti (MMR),
Popravak kroz proteine slične alkiltransferazi (ATL).

Popravak ekscizije baze (BER) uključuje kategoriju enzima poznatih kao DNA-N-glikozilaze.

Jedan od primjera uslužnih programa za automatsko ispravljanje grešaka DNA dovoljan je da omalovaži maštu. Postoje desetine mehanizama za popravak koji štite naš genetski kod od oštećenja; jedan od njih je u Prirodi prikazan na način koji treba da ulije strahopoštovanje.

Iz članka Nature-a: Struktura enzima za obnavljanje koji ispituje neoštećenu DNK pojašnjava prepoznavanje oštećene DNK 11

Slabo je razumljivo kako proteini za popravak DNK razlikuju rijetka mjesta oštećenja od ogromnog prostranstva normalne DNK. Prepoznavanje mutagene lezije 8-ox oguanin (oksoG) predstavlja posebno zastrašujući izazov, jer se ova oksidirana nukleobaza razlikuje za samo dva atoma od svog normalnog kolege, gvanina (G). Rendgenska struktura zarobljenog kompleksa sadrži ciljnu G nukleobazu istisnutu iz zavojnice DNA, ali odbijenu umetanje u džep prepoznavanja lezija enzima. Proračuni razlike u slobodnoj energiji pokazuju da i atraktivne i odbojne interakcije imaju važnu ulogu u preferencijalnom vezivanju oksoG u poređenju sa G na aktivno mesto. Struktura otkriva izuzetno učinkovitu strategiju čuvanja vrata za diskriminaciju lezija i sugerira mehanizam za umetanje oksoG-a u aktivno mjesto hOGG1.

Od četiri baze u DNK (C, G, A i T) citozin ili C uvijek treba da se upari s gvaninom, G, a adenin, A, uvijek treba da se upari s timinom, T. Enzim koji su proučavali Banerjee et al. u prirodi je jedan od mnoštva molekularnih mašina nazvanih BER glikozilaze; ovaj se naziva humani oksoG enzim za popravak glikozilaze (hOGG1), a specijaliziran je za pronalaženje određene vrste grešaka: oksidirana G baza (gvanin). Oksidaciona oštećenja mogu nastati izlaganjem jonizujućem zračenju (poput opekotina od sunca) ili slobodnim radikalima koji se vrte oko jezgre ćelije. Normalni G postaje oksog, čineći ga vrlo malo van forme. Moglo bi ih biti jedan od milion na lancu DNK. Iako se čini kao manja greška u kucanju, to zapravo može dovesti do toga da prevodilačka mašinerija ubaci pogrešnu aminokiselinu u protein, sa katastrofalnim rezultatima, poput raka debelog creva. 12

Mašina se zakači za dvostruku zavojnicu DNA i kreće se niz pramen, osjećajući svaku bazu na putu. U toku, ona uvija DNA lanac pod oštrim uglom. Izgrađen je tako da ignorira baze T i A, ali kad god osjeća C, zna da bi trebao biti pričvršćen G. Mašina ima precizne kontaktne točke za C i G. Kada se C uključi, baza uparena s njom izvlači se iz zavojnice u utor unutar enzima koji je fino izrađen za spajanje sa čistim, čistim G. Ako je sve dobro, vraća G natrag u spiralu DNK i kreće dalje. Ako je osnova oksoG, međutim, ta baza se okreće u drugi utor dalje unutra, gdje moćne sile izvlače pogrešnu bazu iz niti tako da druge mašine mogu umetnuti ispravnu.

Ovo su do sada sve prekrasne stvari, ali kao i kod mnogih stvari u živim ćelijama, pravo je čudo u detaljima. Termodinamičke energetske razlike između G i oksoG izuzetno su male - oksoG sadrži samo jedan dodatni atom kiseonika - a ipak je ova mašina u stanju razlikovati ih do visokog nivoa tačnosti.

Autor David kaže u članku Nature: Strukturna biologija: DNK pretraga i spašavanje
Enzimi za popravak DNK zadivljuju nas svojom sposobnošću da pretražujemo ogromne tragove DNK kako bismo pronašli suptilne anomalije u strukturi. Enzim za popravak kod ljudi 8-oksoguanin glikozilaza (hOGG1) posebno je impresivan u tom pogledu jer efikasno uklanja 8-oksoguanin (oksoG), oštećenu bazu gvanina (G) koja sadrži dodatni atom kiseonika i zanemaruje neoštećene baze.

Prirodna selekcija ne može djelovati bez precizne replikacije, no proteinska mašinerija za nivo preciznosti koji je potreban sama je izgrađena vrlo genetskim kodom koji je stvoren da zaštiti. To je kvaka22 situacija. Bilo bi dovoljno izazovno objasniti tačnu transkripciju i prevođenje samo prirodnim sredstvima, ali kao posljedica UV zračenja brzo bi bilo uništeno gomilanjem grešaka. Dakle, tačna replikacija i lektura potrebne su za nastanak života. Kako bi se, pobogu, mogli pojaviti korektorski enzimi, posebno s ovim stupnjem vjernosti, kada ovise o samim informacijama za koje su stvoreni da ih zaštite? Razmislite o tome .... Ovo je još jedan prima facie primjer situacije sa piletinom i jajima. Koje je alternativno objašnjenje dizajnu? Lektoriranje DNK slučajno? I složeni paket prevodilačkih mašina bez dizajnera?

Uživam kad učim o čudima ovih nevjerovatnih mehanizama. Ako je apostol Pavle mogao shvatiti da stvaranje traži Stvoritelja kao što je napisao u Rimljanima, prvom, 18. poglavlju, koliko više danas sa svim otkrićima o ćelijskoj biologiji i molekularnim mašinama?

https://reasonandscience.catsboard.com/t2043-dna-repair#3475

Mehanizmi za popravak DNK, dizajnirani sa posebnom pažnjom kako bi se osigurala cjelovitost DNK, i neophodni za žive organizme svih domena.
Zapravo, Priroda koristi posebne bjelančevine nazvane ‘lektori za enzim’ kako bi spriječila pojavu blagih promjena u slijedu kada se DNK replicira.

Netačna replikacija vjerovatno bi ograničila veličinu genoma prognoze zbog rizika od "katastrofe greške", nakupljanja toliko genetskih grešaka da organizam više nije održiv. Da bismo ilustrirali ovu stvar, razmotrite problem replikacije genoma od milion baza, što je dovoljno za kodiranje nekoliko hundri d RNK i proteini. (Najmanji poznati genom za postojeću slobodno živuću bakteriju je onaj Pelagibacter ubique, koji se sastoji od 1,3 miliona baza.) Ako je replikacija bila i skromno vjerna, s učestalošću grešaka od 0,1%, svaka replikacija genoma koja se sastoji od 1 milion baze rezultirale bi 1000 greškama, približno jednom ili dvije u svakom genu. Neke od tih pogrešaka bile bi bezopasne, a neke mogle biti korisne, ali mnoge bi bile štetne, što bi dovelo do makromolekula s oštećenim funkcijama.

Oštećenje i popravak DNA-DNK
https://reasonandscience.catsboard.com/t2043-dna-repair?highlight=dna+repair

https://reasonandscience.catsboard.com/t1849p30-dna-replication-of-prokaryotes#4401

Vilice za replikaciju mogu često zastati i zahtijevati neki oblik opravka kako bi se omogućilo dovršavanje hromozomskog umnožavanja. Ne rješavanje ovih replikativnih problema ima visoku cijenu, a posljedice su nestabilnost genoma, ćelijska smrt i, kod viših organizama, rak. Opravak replikacionih vilica, a time i ponovno punjenje DnaB, možda će biti potrebno dalje od oriC u bilo kojoj tački unutar hromozoma i u bilo kojoj fazi tokom hromozomskog umnožavanja. Potencijalno katastrofalni efekti nekontrolisanog započinjanja hromozomske duplikacije na stabilnost genoma sugeriraju da se ponovno pokretanje replikacije mora regulirati tako strogo kao pokretanje replikacije usmjereno na DnaA na oriC. To podrazumijeva da se ponovno učitavanje DnaB mora dogoditi samo na ssDNA na popravljenim vilicama ili D-petljama, a ne na drugim regijama ssDNA, poput onih stvorenih blokovima do sinteze zaostalih lanaca. Tako se tijekom replikacije koristi alternativni protein inicijatora replikacije, PriA helikaza. ponovo pokrenite da biste ponovno učitali DnaB natrag na hromozom

Pitanje: Da li se prva ćelija, sa potrebnim komplementom gena kodiranih DNK, mogla uspješno razmnožavati za značajan broj generacija bez korekturne funkcije? Dalje pitanje je kako je mogla nastati funkcija sinteze zaostalog lanca, kao i mehanizmi za to. Odnosno, Primosome i funkcija polimeraze I za uklanjanje kratkih dijelova RNK koje ćelija koristi za osnovno kopiranje, omogućavajući funkciji polimeraze III da popuni prazninu. Sve ove funkcije zahtijevaju preciznu regulaciju i koordinirane funkcionalne korake nalik mašini. Sve su to složene, napredne funkcije i morale su biti prisutne od početka. Kako se ova složena mašinerija mogla postepeno pojaviti? Primosome je morao biti potpuno funkcionalan, inače polimerizacija nije mogla započeti, jer je potrebna osnovna sekvenca.

Enzimi koji kopiraju DNK u DNK ili DNK u RNK zaista su vrlo pametni. U nekoliko faza tokom sinteze mogu osjetiti da li nešto ide po zlu; na primjer, ako su dodali ili će namjeravati dodati pogrešnu bazu, prema pravilima uparivanja Watson – Crick. Također, postoje enzimi za "popravljanje" koji uokolo ispravljaju pogreške kopiranja ili "neusklađenosti". Stoga se priroda trudi da izbjegne greške u kopiranju DNK, iako su atomi u strukturi DNK u stvari prilično tolerantni prema uparivanju neusklađenosti. Ovi enzimi izuzetno su efikasni u obavljanju svog posla, ali niko ne zna tačno kako rade.

Dokazi popravkom DNA-DNK
1. Slomljeni ili neusklađeni lanci DNK mogu dovesti do ozbiljnih bolesti, pa čak i smrti. Bitno je da se oštećenja DNK prepoznaju i brzo poprave.
2. Tim sa Sveučilišta Rockefeller i Medicinskog fakulteta Harvard koji je pronašao dva bitna proteina koja djeluju poput "molekularnih krojača" koji mogu otkriti grešku i sašiti je ispravnim molekulima.
3. Ovi proteini, FANC1 i FANCD2, popravljaju međulančane unakrsne veze, „jednu od najsmrtonosnijih vrsta oštećenja DNK“. Ovaj se problem "javlja kada su dvije niti dvostruke zavojnice povezane zajedno, blokirajući replikaciju i transkripciju."
4. Svaka vaša ćelija vjerojatno će dobiti 10 poziva za uzbunu dnevno za međusobno povezane mrežne veze.
5. FANC1 i FANCD2 povezuju se i pridružuju ostalim članovima puta popravka i prisno su uključeni u korake izrezivanja i umetanja.
6. Jedna operacija popravka zahtijeva 13 dijelova proteina.
7. "Ako je bilo koji od 13 proteina na ovom putu oštećen, rezultat je Fanconijeva anemija, poremećaj krvi koji dovodi do zatajenja koštane srži i leukemije, između ostalog karcinoma, kao i mnogih fizioloških nedostataka."
a. "Naši rezultati pokazuju da višestruki koraci osnovnog mehanizma popravljanja ICL u S-fazi ne uspijevaju kada se ugrozi put Fanconijeve anemije."
8. U znanstvenom radu i priopćenju za javnost nije spomenut Darwin niti mogući način na koji se mogao razvijati ovaj čvrsto integrirani sistem.
9. Apsolutna neophodnost FANC1 i FANCD2 vrlo su očigledne iz ovog otkrića ne samo kod jedne vrste već i kod svih koji imaju DNK. Njihova presudna uloga za opstanak vrste nije zaobići.
10. Morali su postojati savršeno funkcionalne jedinice od vremena pojave bilo koje vrste na ovoj planeti u suprotnom postojanje ne bi bilo moguće.
11. To podrazumijeva stvaranje što dalje podrazumijeva da Bog nužno postoji.

Referenca:
1. Knipscheer i suradnici, „Put Fanconijeve anemije promovira popravak umreženih veza DNK ovisan o replikaciji“, Nauka, 18. decembar 2009.: sv. 326. br. 5960, str. 1698-1701, DOI: 10.1126 / science.1182372.

Argument iz kodova za otkrivanje / ispravljanje
1. GCL binarni prikaz omogućava postojanje kodova za otkrivanje / ispravljanje grešaka koji djeluju duž niti DNA.
2. „Mehanizam kontrole grešaka podrazumijeva organizaciju redundancije na matematički strukturiran način“, a „genetski kod pokazuje snažnu matematičku strukturu koju je teško staviti u vezu s biološkim prednostima, osim korekcijom grešaka“.
3. Poseban i jedinstven matematički model objašnjava ključna svojstva genetskog koda koji pokazuje simetriju, organiziranu redundanciju i matematičku strukturu ključnu za postojanje tehnika kodiranja grešaka koje djeluju duž DNK lanaca.
4. DNK podaci testirani pomoću ovog modela dali su snažnu naznaku da tehnike kodiranja grešaka postoje.
5. Takav divan dizajn ukazuje na svrsishodno stvaranje koje dalje ukazuje na postojanje Boga.
6. Bog najverovatnije postoji.

Dokazi o Rad51
1. Naučnici iz Nacionalnog laboratorija Lawrence Berkeley u svom eseju: „Zaštita integriteta genoma izvanrednom popravkom DNK“ pišu:
Homologna rekombinacija je složeni mehanizam sa više koraka, ali takođe i sa mnogim tačkama regulacije kako bi se osigurala precizna rekombinacija u svakoj fazi. To bi mogao biti razlog zašto je ova metoda favorizovana tokom evolucije. Mašine koje premeštaju oštećenu DNK pre punjenja Rad51 mogle su se razviti jer bi posledice njenog nepostojanja bile strašne.

2. Ako je evolucija slučajan proces bez cilja ili svrhe, ne bi bilo briga hoće li se nešto pojaviti ili ne. Kako bezumni proces može favorizovati metodu? Kako bi bezumni proces „znao“ da bi posljedice nemanja nečega bile strašne? Kako bi to motivisalo ne-um da proizvodi mašine i složene mehanizme kako bi izbjegao strašne posljedice?

3. Stoga, umjesto da se kaže ‘Rad51 je možda evoluirao’, jasno je da je Rad51 dizajnirao inteligentni dizajner, jer bez tako složenog mehanizma s više koraka s mnogim točkama regulacije kako bi se osigurala precizna rekombinacija u svakoj fazi, život ne bi mogao postojati.

4. Sposobnost Rad51 koji ima sposobnost izvanrednog popravljanja DNK dokazuje postojanje inteligentnog dizajnera kojeg svi ljudi nazivaju Bogom.
5. Bog najverovatnije postoji.

Popravak DNA-DNK

http://reasonandscience.heavenforum.org/t2043-dna-repair?highlight=dna+repair

Provjera i popravak DNK i RNA pogrešaka, nevjerojatni dokazi dizajna Dna_re13

Mehanizmi popravljanja DNK nemaju smisla u evolucijskoj pretpostavci. Ispravljanje pogrešaka zahtijeva otkrivanje grešaka, a to zahtijeva postupak otkrivanja kako bi se DNK mogao usporediti kakav jest s onim kakav bi trebao biti. Popravak DNK smatra se jednim od bitnih događaja u svim oblicima života. 18 Stabilnost genoma je bitna za pravilnu funkciju i opstanak svih organizama. Oštećenje DNK je vrlo često i čini se da je osnovni životni problem. Oštećenje DNK može pokrenuti razvoj raka i ubrzati starenje. 19

Kunkel, T.A., DNA Replication Fidelity, J. Biological Chemistry 279: 16895–16898, 23. aprila 2004.

Ova mašina smanjuje stopu grešaka na manje od jedne greške na 100 miliona slova

Održavanje genetske stabilnosti koja je organizmu potrebna za preživljavanje zahtijeva ne samo izuzetno precizan mehanizam za replikaciju DNK, već i mehanizme za popravak mnogih slučajnih lezija koje se neprestano javljaju u DNK. Većina takvih spontanih promjena u DNK su privremene jer se odmah ispravljaju nizom procesa koji se zajednički nazivaju popravkom DNK. Od hiljada slučajnih promjena koje se svakodnevno stvaraju u DNK ljudske ćelije vrućinom, metaboličkim nesrećama, zračenjem raznih vrsta i izloženošću supstancama u okolini, samo se nekoliko akumulira kao mutacije u sekvenci DNK. Na primjer, sada znamo da manje od jedne na 1000 slučajnih promjena baze u DNK rezultiraju trajnom mutacijom; ostali se uklanjaju izvanrednom efikasnošću popravkom DNK. Važnost popravljanja DNK očituje se iz velikog ulaganja koje ćelije ulažu u enzime za popravak DNK. Na primjer, analiza genoma bakterija i kvasca otkrila je da je nekoliko posto kodirajućeg kapaciteta ovih organizama posvećeno samo funkcijama popravljanja DNK.

Bez popravka DNK, spontano oštećenje DNK brzo bi promijenilo sekvence DNK

Iako je DNK izuzetno stabilan materijal, potreban za čuvanje genetskih informacija, riječ je o složenom organskom molekulu koji je podložan, čak i pod normalnim staničnim uvjetima, spontanim promjenama koje bi dovele do mutacija ako se ne poprave.

Oštećenje DNK je promjena i n hemijskoj strukturi DNK, poput prekida lanca DNK, baze koja nedostaje u okosnici DNK ili hemijski promijenjene baze. 15
Oštećenja DNK u prirodi nastaju više od 60.000 puta dnevno po ćeliji sisara.

Čini se da je oštećenje DNK osnovni životni problem. Oštećenja DNK glavni su primarni uzrok raka. Oštećenja DNK uzrokuju mutacije i epimutacije koje postupkom prirodne selekcije mogu uzrokovati napredovanje u rak. 16

Različiti putevi za popravak DNK

Mehanizmi za popravak DNK spadaju u 2 kategorije

- Popravak oštećenih baza
- Popravak pogrešno baziranih baza u toku replikacije

Stanice imaju višestruke puteve za popravak svoje DNK koristeći različite enzime koji djeluju na različite vrste lezija.

Postoje najmanje četiri puta ekscizijskog popravka za saniranje oštećenja jednolančane DNK:

Popravak ekscizije nukleotida (NER)
Popravak ekscizije baze (BER)
Popravak neusklađenosti DNK (MMR)
Popravak putem proteina sličnih alkiltransferazi (ATL)

U većini slučajeva popravak DNK je postupak u više koraka

- 1. Otkrivena je nepravilnost u strukturi DNK
- 2. Nenormalna DNK se uklanja
- 3. Sintetiše se normalna DNK

Baze DNK takođe povremeno oštećuju susret sa reaktivnim metabolitima proizvedenim u ćeliji (uključujući reaktivne oblike kiseonika) ili izlaganjem hemikalijama u okolini. Isto tako, ultraljubičasto zračenje sunca može stvoriti kovalentnu vezu između dvije susjedne baze pirimidina u DNK da bi se stvorili, na primjer, timinski dimerovi. Ova vrsta oštećenja nastaje u DNK ćelija izloženih ultraljubičastom zračenju ili zračenju (kao na sunčevoj svjetlosti) Sličan dimer stvorit će se između bilo koje dvije susjedne baze pirimidina (C ili T ostaci) u DNK. (vidi dolje)

Ako se ostane neispravljena kada se DNK replicira, očekivalo bi se da će većina ovih promjena dovesti ili do brisanja jednog ili više baznih parova ili do supstitucije baznih parova u lancu kćeri DNA. (vidi dolje) Mutacije bi se zatim širile tokom narednih generacija ćelija. Tako visoka stopa slučajnih promjena u sekvenci DNK imala bi katastrofalne posljedice za organizam

Očito je da je mehanizam popravka od suštinskog značaja za preživljavanje ćelije. Nije mogao evoluirati nakon što je život nastao, ali je morao postojati prije. Mehanizam je vrlo složen i razrađen, što ima za posljedicu da je zaključak o dizajnu opravdan i čini se da je najbolji način da se objasni njegovo postojanje.

Dvostruka zavojnica DNA lako se popravlja
Dvostruka spiralna struktura DNK idealna je za popravak jer nosi dvije odvojene kopije svih genetskih informacija - po jednu u svaka od svoja dva lanca. Dakle, kada je jedan lanac oštećen, komplementarni lanac zadržava netaknutu kopiju istih podataka i ta se kopija obično koristi za vraćanje ispravnih nukleotidnih sekvenci na oštećeni lanac. Pokazatelj važnosti dvolančane zavojnice za sigurno skladištenje genetskih informacija je da je sve ćelije koriste; samo nekoliko malih virusa koristi jednolančanu DNK ili RNK kao svoj genetski materijal. Vrste procesa popravka opisane u ovom odjeljku ne mogu djelovati na takve nukleinske kiseline, a nakon što su oštećene, šansa za trajnu promjenu nukleotida u ovim jednolančanim genomima virusa stoga je vrlo velika. Čini se da samo organizmi sa sićušnim genomima (a samim tim i sićušnim ciljevima za oštećenje DNK) mogu priuštiti kodiranje svojih genetskih informacija u bilo koji molekul koji nije dvostruka spirala DNK. Ispod su prikazana dva najčešća puta. U oba se oštećenja izrezuju, izvorna sekvenca DNK obnavlja se DNK polimerazom koja koristi neoštećeni lanac kao svoj obrazac, a preostali prekid dvostruke zavojnice zapečaćen je DNA ligazom.

DNA ligaza.

Reakcija katalizirana DNA ligazom. Ovaj enzim zaptiva prekinutu fosfodiestersku vezu. Kao što je prikazano, DNA ligaza koristi molekul ATP da aktivira 5 'kraj na zarezu (korak 1) prije formiranja nove veze (korak 2). Na taj se način energetski nepovoljna reakcija zatvaranja zareza pokreće povezivanjem s energetski povoljnom
proces hidrolize ATP-a.

Glavna dva puta razlikuju se u načinu na koji uklanjaju oštećenja sa DNK. Prvi put, tzv

Popravak ekscizije baze (BER) 9
Uključuje bateriju enzima nazvanih DNA glikozilaze, od kojih svaka može prepoznati određenu količinu promijenjene baze u DNK i katalizirati njezino hidrolitičko uklanjanje. Postoji najmanje šest vrsta ovih enzima, uključujući one koji uklanjaju deaminirane Cs, deaminirane As, različite vrste alkiliranih ili oksidiranih baza, baze s otvorenim prstenovima i baze u kojima je dvostruka veza ugljik-ugljik slučajno pretvorena u ugljik -karbonska jednostruka veza.

Kako se otkriva promijenjena baza u kontekstu dvostruke zavojnice? Ključni korak je enzimski posredovano "izbacivanje" izmijenjenog nukleotida iz zavojnice, koje omogućava DNK glikozilazi da istražuje sva lica baze zbog oštećenja (vidi gornju sliku). Smatra se da ti enzimi putuju duž DNK koristeći base-flipping za procjenu statusa svake baze. Jednom kada enzim pronađe oštećenu bazu koju prepozna, uklanja bazu iz šećera. "Zub koji nedostaje" stvoren djelovanjem DNK glikozilaze prepoznaje enzim nazvan AP endonukleaza (AP za apurinski ili apirimidinski, endo koji označava da se nukleaza cijepa unutar polinukleotidnog lanca), koji presijeca okosnicu fosfodiestera, nakon čega se uklanja oštećenje i nastali jaz popravljen (vidi sliku dolje). Odstupanje, koje je ubedljivo najčešći zrelo oštećenje koje pretrpi DNK, takođe ostavlja deoksiribozni šećer bez baze. Odlasci se direktno popravljaju počevši od AP endonukleaze.

Iako BER put može prepoznati specifične glomazne lezije u DNK, može ispraviti samo oštećene baze koje uklanjaju specifične glikozilaze. Slično tome, MMR put cilja samo neusklađene Watson-Crick bazne parove. 2

Molekularna lezija Molekularna lezija ili točkovna lezija predstavlja oštećenje strukture biološkog molekula kao što je DNK, enzimi ili proteini koje rezultira smanjenjem ili odsustvom normalne funkcije ili, u rijetkim slučajevima, dobitkom nove funkcije. Lezije u DNK sastoje se od prekida i drugih promjena u hemijskoj strukturi zavojnice (vidi vrste DNK lezija), dok se lezije u proteinima sastoje od raskida veza i nepravilnog presavijanja aminokiselinskog lanca. 6

DNA-N-glikozilaze
Popravak ekscizije baze (BER) uključuje kategoriju enzima poznatih kao DNA-N-glikozilaze. Ti enzimi mogu prepoznati jednu oštećenu bazu i razdvojiti vezu između nje i šećer u DNK uklanja jednu bazu, izrezuje nekoliko oko nje i zamjenjuje sa nekoliko novih baza pomoću Pola dodajući na 3 'krajeve, a zatim ligazu vežući se na 5' krajeve

DNK glikozilaze su porodica enzima uključenih u popravak ekscizije baze, klasifikovane pod EC broj EC 3.2.2. Popravak ekscizije baze je mehanizam kojim se oštećene baze u DNK uklanjaju i zamjenjuju. DNK glikozilaze kataliziraju prvi korak ovog procesa. Oni uklanjaju oštećenu azotnu bazu, dok ostave okosnicu šećer-fosfata netaknutom, stvarajući apurinsko / apirimidinsko mjesto, koje se obično naziva AP mjestom. To se postiže izbacivanjem oštećene baze iz dvostruke zavojnice, nakon čega slijedi cijepanje N-glikozidne veze. Glikozilaze su prvi put otkrivene u bakterijama i od tada su pronađene u svim kraljevstvima života. 8

Jedan od primjera uslužnih programa za automatsko ispravljanje grešaka DNA dovoljan je da omalovaži maštu. Postoje desetine mehanizama za popravak koji štite naš genetski kod od oštećenja; jedan od njih je u Prirodi prikazan na način koji treba da ulije strahopoštovanje. 10

Kako enzimi za popravak DNK pronalaze aberantne nukleotide među bezbroj normalnih?
Jedan enzim je uhvaćen u procesu provjere oštećenja, pružajući tragove u njegovom procesu kontrole kvaliteta.

Iz članka Nature-a: Struktura enzima za obnavljanje koji ispituje neoštećenu DNK pojašnjava prepoznavanje oštećene DNK 11

Slabo je razumljivo kako proteini za popravak DNK razlikuju rijetka mjesta oštećenja od ogromnog prostranstva normalne DNK. Prepoznavanje mutagene lezije 8-oksoguanin (oksoG) predstavlja posebno zastrašujući izazov, jer se ova oksidirana nukleobaza razlikuje za samo dva atoma od svog normalnog kolege, gvanina (G). Rendgenska struktura zarobljenog kompleksa sadrži ciljnu G nukleobazu istisnutu iz zavojnice DNA, ali odbijenu umetanje u džep prepoznavanja lezija enzima. Proračuni razlike u slobodnoj energiji pokazuju da i atraktivne i odbojne interakcije imaju važnu ulogu u preferencijalnom vezivanju oksoG u poređenju sa G na aktivno mesto. Struktura otkriva izuzetno učinkovitu strategiju čuvanja vrata za diskriminaciju lezija i sugerira mehanizam za umetanje oksoG-a u aktivno mjesto hOGG1.

Od četiri baze u DNK (C, G, A i T) citozin ili C uvijek treba da se upari s gvaninom, G, a adenin, A, uvijek treba da se upari s timinom, T. Enzim koji su proučavali Banerjee et al. u prirodi je jedan od mnoštva molekularnih mašina nazvanih BER glikozilaze; ovaj se naziva humani oksoG enzim za popravak glikozilaze (hOGG1), a specijaliziran je za pronalaženje određene vrste grešaka: oksidirana G baza (gvanin). Oksidaciona oštećenja mogu nastati izlaganjem jonizujućem zračenju (poput opekotina od sunca) ili slobodnim radikalima koji se vrte oko jezgre ćelije. Normalni G postaje oksog, čineći ga vrlo malo van forme. Moglo bi ih biti jedan od milion na lancu DNK. Iako se čini kao manja greška u kucanju, to zapravo može dovesti do toga da prevodilačka mašinerija ubaci pogrešnu aminokiselinu u protein, sa katastrofalnim rezultatima, poput raka debelog creva. 12

Mašina se zakači za dvostruku zavojnicu DNA i kreće se niz pramen, osjećajući svaku bazu na putu. U toku, ona uvija DNA lanac pod oštrim uglom. Izgrađen je tako da ignorira baze T i A, ali kad god osjeća C, zna da bi trebao biti pričvršćen G. Mašina ima preciznu kontaktičke točke za C i G. Kada se C uključi, baza koja mu je uparena izvlači se iz zavojnice u utor unutar enzima koji je fino oblikovan za spajanje sa čistim, čistim G. Ako je sve u redu, okreće se G se vraća u spiralu DNK i kreće dalje. Ako je osnova oksoG, međutim, ta baza se okreće u drugi utor dalje unutra, gdje moćne sile izvlače pogrešnu bazu iz niti tako da druge mašine mogu umetnuti ispravnu.

Ovo su do sada sve prekrasne stvari, ali kao i kod mnogih stvari u živim ćelijama, pravo je čudo u detaljima. Termodinamičke energetske razlike između G i oksoG izuzetno su male - oksoG sadrži samo jedan dodatni atom kiseonika - a ipak je ova mašina u stanju razlikovati ih do visokog nivoa tačnosti.

Autor David kaže u članku Nature: Strukturna biologija: DNK pretraga i spašavanje

Enzimi za popravak DNK zadivljuju nas svojom sposobnošću da pretražujemo ogromne tragove DNK kako bismo pronašli suptilne anomalije u strukturi. Enzim za popravak kod ljudi 8-oksoguanin glikozilaza (hOGG1) posebno je impresivan u tom pogledu jer efikasno uklanja 8-oksoguanin (oksoG), oštećenu bazu gvanina (G) koja sadrži dodatni atom kiseonika i zanemaruje neoštećene baze.

Tim koji je predvodio Anirban Banerjee sa Harvarda, koristeći pametnu novu metodu zaustavljanja djelovanja slike, uhvatio je ovaj mali enzim u vezivanju lošeg gvanina, pomažući naučnicima da vizualiziraju kako mašine rade. O ovom molekularnom korektoru spominju se još neki nevjerojatni detalji. Provjerava svaki C-G par, ali promiče tačno pored A-T parova. Enzim, „slično vlaku koji se zaustavlja samo na određenim lokacijama“, zastaje na svakom C i, bolje od bilo kog kočijaša koji pregledava svaku kartu, okreće G da bi ga potvrdio. Osim ako se savršeno ne prilagodi utoru - iako se G i oxoG međusobno razlikuju po samo jednoj vodoničnoj vezi - izbacuju se poput utovarivača u Pullmanovom automobilu i bacaju u pustinju. David objašnjava:

Proračuni razlika u slobodnoj energiji pokazuju da i povoljne i nepovoljne interakcije dovode do preferencijalnog vezivanja oksoG nad G u džepu za prepoznavanje oksoG i G nad oksoG na alternativnom mestu. Ova struktura [slika koju je razriješio znanstveni tim] snima intermedijar koji nastaje u procesu pronalaženja oksoG i ilustrira da oštećena baza mora proći kroz niz 'kapija' ili kontrolnih točaka unutar enzima; samo oxoG zadovoljava uslove za prijem u džep specifičan za štetu, gdje će biti izvađen iz DNK. Ostale baze (C, A i T) mogu se odbiti izravno bez istiskivanja iz zavojnice, jer hOGG1 pažljivo proučava obje baze u svakom paru, a samo će se baze nasuprot C detaljnije ispitati.

Prirodna selekcija ne može djelovati bez precizne replikacije, no proteinska mašinerija za nivo preciznosti koji je potreban sama je izgrađena vrlo genetskim kodom koji je stvoren da zaštiti. To je kvaka22 situacija. Bilo bi dovoljno izazovno objasniti tačnu transkripciju i prevođenje samo prirodnim sredstvima, ali kao posljedica UV zračenja brzo bi bilo uništeno gomilanjem grešaka. Dakle, tačna replikacija i lektura potrebne su za nastanak života. Kako bi se, pobogu, mogli pojaviti korektorski enzimi, posebno s ovim stupnjem vjernosti, kada ovise o samim informacijama za koje su stvoreni da ih zaštite? Razmislite o tome .... Ovo je još jedan prima facie primjer situacije sa piletinom i jajima. Koje je alternativno objašnjenje dizajnu? Lektoriranje DNK slučajno? I složeni paket prevodilačkih mašina bez dizajnera?

Uživam kad učim o čudima ovih nevjerovatnih mehanizama. Ako je apostol Pavle mogao shvatiti da stvaranje traži Stvoritelja kao što je napisao u Rimljanima, prvom, 18. poglavlju, koliko više danas sa svim otkrićima o ćelijskoj biologiji i molekularnim mašinama?

Budući da sama mašina za uređivanje zahtijeva ispravnu lekturu i montažu tokom proizvodnje, kako bi se informacije o mašini tačno prenijele prije nego što je mašina postavljena i ispravno radi? Da se ne bi tvrdilo da se tačnost može postići postepeno odabirom, imajte na umu da je potreban visok stepen preciznosti kako bi se spriječila "katastrofa greške" u prvom redu - od nakupljanja "buke" u obliku bezvrijednih proteina navedenih u oštećena DNK. 18

Ovisno o vrsti, ovaj sistem popravka može eliminirati abnormalne baze kao što je Uracil; Timinski dimeri 3-metiladenin; 7-metilgvanin

Provera i popravak grešaka DNK i RNA, neverovatni dokazi o dizajnu KEGG_PATHWAY_Base_excision_repair
14

Budući da su mnoge mutacije štetne, sustavi za obnavljanje DNK su vitalni za opstanak svih organizama

Žive ćelije sadrže nekoliko sistema za popravak DNK koji mogu popraviti različite vrste DNK promjena

Popravak ekscizije nukleotida (NER)

Popravak nukleotidne ekscizije je mehanizam za popravak DNK. DOštećenja NA nastaju stalno zbog kemikalija (tj. Sredstava za interkaliranje), zračenja i drugih mutagenih tvari.

Popravak nukleotidne ekscizije (NER) visoko je konzervirani mehanizam za popravak DNK. NER sistemi prepoznaju oštećeni DNA lanac, cijepaju ga s obje strane lezije, uklanjaju i novo sintetiziraju fragment. UvrB je središnja komponenta bakterijskog NER sistema koji sudjeluje u prepoznavanju oštećenja, eksciziji niti i sintezi popravljanja. [/ B] Riješili smo kristalnu strukturu UvrB u apo i ATP vezanim oblicima. UvrB sadrži dvije domene povezane po strukturi s helikazama i dvije dodatne domene jedinstvene za obnavljanje proteina. Struktura sadrži sve elemente netaknute helikaze i dokaz je da UvrB koristi hidrolizu ATP-a kako bi se kretao duž DNK kako bi istraživao oštećenja. Lokacija sačuvanih ostataka i strukturna poređenja omogućuju nam da predvidimo put DNK i sugeriramo da se čvrsti kompleks preciznosti UvrB i oštećena DNK formiraju umetanjem fleksibilne Î-ukosnice između dva lanca DNK. 3

DNK stalno treba popravljati zbog oštećenja koja mogu nastati na bazama iz velikog broja različitih izvora, uključujući hemikalije, ali i ultraljubičastu (UV) svjetlost od sunca. Popravak nukleotidne ekscizije (NER) posebno je važan mehanizam pomoću kojeg ćelija može spriječiti neželjene mutacije uklanjanjem velike većine oštećenja DNK izazvanog UV zračenjem (uglavnom u obliku timinskih dimera i 6-4 foto-proizvoda). O važnosti ovog mehanizma popravka svjedoče teške ljudske bolesti koje su rezultat urođenih genetskih mutacija NER proteina, uključujući Xeroderma pigmentosum i Cockayneov sindrom. Iako osnovni strojevi za popravak ekscizije mogu prepoznati specifične lezije u DNK i mogu ispraviti samo oštećene baze koje se mogu ukloniti specifičnom glikozilazom, nukleotidni enzimi za eksciziju popravljaju glomazna izobličenja u obliku dvostruke spirale DNK. Prepoznavanje ovih izobličenja dovodi do uklanjanja kratkog jednolančanog DNK segmenta koji uključuje leziju, stvarajući jednolančanu prazninu u DNK, koja se potom popunjava DNK polimerazom, koja koristi neoštećeni lanac kao obrazac. NER se može podijeliti u dva potputa (Globalni genomski NER i Transkripcijski spojeni NER) koji se razlikuju samo po prepoznavanju oštećenja DNK koja iskrivljuje heliks. 4

Popravak nukleotidne ekscizije (NER) posebno je važan mehanizam ekscizije koji uklanja oštećenja DNK izazvana ultraljubičastim svjetlom (UV). 2UV oštećenje DNK rezultira glomaznim aduktima DNK - ti su adukti uglavnom timinski dimeri i 6,4-fotoprodukti. Prepoznavanje oštećenja dovodi do uklanjanja kratkog jednolančanog DNK segmenta koji sadrži leziju. Neoštećena jednolančana DNK ostaje i DNK polimeraza je koristi kao predložak za sintezu kratke komplementarne sekvence. Konačna ligacija da se završi NER i formira dvolančana DNK provodi se DNA ligazom. NER se može podijeliti u dva podputa: globalni genomski NER (GG-NER) i transkripcijski spojeni NER (TC-NER). Dva se podputa razlikuju u načinu prepoznavanja oštećenja DNK, ali dijele isti postupak za rezanje lezija, popravak i ligaciju.

O važnosti NER-a svjedoče teške ljudske bolesti koje su rezultat urođenih genetskih mutacija NER proteina. Xeroderma pigmentosum i Cockayneov sindrom su dva primjera bolesti povezanih s NER-om.

Održavanje genomskog integriteta neophodno je za žive organizme. NER je glavni put koji omogućava uklanjanje lezija koje bi se inače akumulirale i ugrozile zdravlje pogođenog organizma. 5

Popravak nukleotidne ekscizije (NER) mehanizam je za prepoznavanje i saniranje glomaznih oštećenja DNK uzrokovanih spojevima, kancerogenim sredinama u okolišu i izloženosti UV svjetlu. Nasljedni defekti na putu NER-a kod ljudi povezani su s najmanje tri bolesti: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayneov sindrom (CS) i trihotiodistrofija (TTD). Popravak oštećene DNK uključuje najmanje 30 polipeptida unutar dva različita pod-puta NER-a, poznata kao popravak povezan transkripcijom (TCR-NER) i globalni popravak genoma (GGR-NER). TCR se odnosi na ubrzani popravak lezija smještenih u aktivno transkribiranom lancu gena pomoću RNA polimeraze II (RNAP II). U GGR-NER-u prvi korak prepoznavanja oštećenja uključuje XPC-hHR23B kompleks zajedno sa XPE kompleksom (u prokarionima uvrAB kompleks). Sljedeći koraci GGR-NER i TCR-NER su slični.

Provjera i popravak grešaka DNK i RNA, nevjerojatni dokazi dizajna KEGG_PATHWAY_Nucleotide_excision_repair 1

1) http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?ko03420